为了前往绿岭市，小智他们正在岛与岛之间渡海旅行。
小刚拿出了地图道：“前面有个叫瑞弗勒的小岛，通信船将会在这里停半天，傍晚的时候再次出发。”
小胜期待道：“那我们可以在岛上好好逛逛，要是能遇到罕见的水系宝可梦就好了！”
小遥道：“说不定岛上还有美味的餐厅！啊，你们看，那里有只跳跳猪！”小遥看到一根浮木上站着一只跳跳猪。
这时一道浪打来，小刚当即立断道：“巨牙鲨，去救跳跳猪！”
巨牙鲨将差点溺水的跳跳猪拖到了船上，小刚关切问道：“你没事吧！”
跳跳猪似乎被救了很高兴被救了，跳来跳去的。意外却发生了，跳跳猪撞到了船边，头上的珍珠掉到了海里。
跳跳猪焦急的哭了起来，小智他们将身上的水系宝可梦都派出去寻找跳跳猪的珍珠，只是一众宝可梦寻找了很久，直到船都靠岸了很久，都没有找到，大海捞针形容的就是现在这个情况了。
一众宝可梦都陆续返回，没有任何一只找到跳跳猪的珍珠。
跳跳猪看上去很是伤心，小刚安慰道：“只能给跳跳猪再找一颗珍珠了！”
小胜疑惑道：“小刚怎么找啊！”
小智解释道：“找珍珠贝！珍珠贝的所产的珍珠就是跳跳猪头上的珍珠。”
小遥道：“现在也只能这样了，在小岛上应该找珍珠贝也不难。”
一群人找着找着，遇到了一个身穿白大褂的研究人员。那人道：“这只跳跳猪的珍珠？”
小刚解释道：“它的珍珠掉到海里了，现在我们在找珍珠贝希望帮它再找一颗珍珠。”
那人道：“原来如此，我叫伊崎就是在这座岛上的研究所研究珍珠贝的，也许我能帮忙。”
小刚道：“真的吗？谢谢你了！”
伊崎带着小智一行人到研究所里，只是研究所的珍珠贝都没有新诞生出珍珠的。突然跳跳猪很兴奋的看着展柜里一颗蓝色的珍珠。
伊崎抱歉道：“跳跳猪那颗蓝色的珍珠还在调查，所以不能给你。现在也只好去珍珠贝聚集的地方找找看了。”
跳跳猪再次失落，小刚将其抱在怀中安慰道：“没事的，我们会帮你找到一颗新的珍珠的。”
小智他们前往了野生珍珠贝栖息的海滩，但研究所里的这颗蓝色珍珠被火箭队的人给盯上了。三人组翻墙进入带着珍珠跑路的时候，被石头绊了一下，那颗蓝色珍珠竟意外的滚到了跳跳猪的身边，跳跳猪很开心的将珍珠顶在了头上。
伊崎道：“这不是研究所的那颗蓝色珍珠吗？跳跳猪，请你还给我好吗？”
跳跳猪不愿意，它好不容易又有珍珠了，又不是在研究所拿的，而是自己滚到它身边的，跳跳猪不愿意还给伊崎。
跳跳猪逃跑了！
逃跑的时候，跳跳猪又跌倒了，这次蓝色的珍珠意外跟海滩上的一只珍珠贝的粉色珍珠更换了，小智他们找到跳跳猪的时候，它头上的珍珠已经变回了粉色。
小遥道：“怎么会是粉色的？”
伊崎道：“这确实是粉色的珍珠，那蓝色那颗呢？”
在附近玩耍的孩子走了过来道：“我们知道是怎么回事！刚才这只跳跳猪摔倒了，头上的蓝色珍珠就跟那边那只珍珠贝的珍珠调换了！”
小胜道：“你们看还真的是哎！”
小胜所指的那只珍珠贝的贝壳中就是那颗蓝色珍珠。
小智上前道：“珍珠贝，这颗蓝色的珍珠对伊崎先生很重要能不能还给我们呢？”
珍珠贝摇了摇头。
伊崎也拜托道：“珍珠贝，拜托你了！”